As Esponjas podem se reproduzir assexuada e sexuadamente. A reprodução assexuada ocorre por gemas , que se desenvolvem como saliências externas ao corpo , e por gêmulas, que são também formas de resistências nas esponjas de água doce. Cada gêmula é um conjunto de células indiferenciadas , protegidas por uma camada externa de espículas , que conseguem suportar longos períodos de exposição ao ar, produzindo cada uma um novo indivíduo quando as condições ambientais voltam ao normal. A reprodução por genes produz um grande número de novos indivíduos que permanecem interligados, formando extensas colônias , geralmente incrustantes, sobre rochas submersas. Elas mostram inúmeros poros e são de diferentes cores, determinadas, com frequência , por várias espécies de algas microscópicas e também cianobactérias simbiônticas. A reprodução sexuada se dá pela fecundação dos óvulos por espermatozóides trazidos de outras esponjas pela água circulante. Do zigoto resultante formam-se microscópicas larvas ciliadas que se desenvolvem em novos indivíduos.
