É no intestino que ocorre a etapa final da digestão e também a absorção de nutrientes . Constitui-se de um tubo cujo comprimento varia na dependência do tipo de alimentação do animal; nos herbívoros é longo e nos carnívoros relativamente curto. O intestino tem inicio no piloro , válvula muscular (esfíncter) que o separa do estômago. Com exceção dos peixes , nos demais vertebrados o intestino é dividido em duas partes: uma anterior , o intestino delgado, e outra posterior, o intestino grosso. A absorção ocorre no intestino delgado , que apresenta vilosidades intestinais , que aumentam a superfície de absorção . Nos peixes , o intestino é um tubo relativamente uniforme, apresentando estruturas que aumentam a superfície de absorção dos alimentos : nos condríctios existe uma válvula espiral, e nos osteíctios existem cercos pilóricos.
